
Okano Makoto dipindahkan ke sekolah di kota asalnya. Di sana, dia menghabiskan hari-hari sekolah yang normal namun bahagia bersama saudara perempuannya, Hinata, teman sekelas yang lucu, Tachibana Tsutomu, Shikouin Kasumi, teman masa kecil Tsutomu, dan teman-teman lainnya. Suatu hari, sepulang sekolah, Makoto mendengar seseorang memainkan harmonika. Melodi itu membuatnya merasakan sesuatu yang kuno, dan membawanya ke atap gedung sekolah. Di sana, dia bertemu dengan seorang gadis di senja hari. Narukaze Minamo-lah yang menoleh ke arahnya sambil tersenyum. Dia adalah teman masa kecil, tapi mereka telah hidup terpisah selama bertahun-tahun. Menyembunyikan pikiran mereka yang sebenarnya, Makoto dan teman-temannya menghabiskan hidup mereka di sekolah. Kisah mereka di kota misterius akan segera dimulai.