
32 tahun telah berlalu sejak kekalahan awal penjajah. A.E.G.I.S sekarang sudah dibongkar dan telah menjadi organisasi bawah tanah yang hanya terdiri dari beberapa Penjaga Gerbang yang tersisa untuk menyelamatkan umat manusia. Salah satu anggotanya, Ayane Isuzu, muak dengan masyarakat secara keseluruhan, meskipun dia terus mengalahkan Invaders karena dendam terhadap ayahnya. Tiba-tiba, dia mengetahui kebangkitan Jenderal Mesin (Kikai Shogun) dan Penghitung Iblis (Akuma Hakushaku), namun seorang gadis hantu misterius kini menemani mereka. Terserah pada Ayane dan sisa-sisa A.E.G.I.S untuk menghentikan mereka dan menyelamatkan umat manusia sekali lagi. (Sumber: Jaringan Berita Anime)